Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHE41Q9C0J9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms