Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms