Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms