Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT23Q9C075 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms