Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms