Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP1Q9C000 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP1Q9C000 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms