Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSCC1Q9BVC3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSCC1Q9BVC3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms