Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
THUMPD2Q9BTF0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms