Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms