Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSF1Q96T23 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms