Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms