Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms