Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms