Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms