Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SAMD8Q96LT4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SAMD8Q96LT4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SAMD8Q96LT4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SAMD8Q96LT4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SAMD8Q96LT4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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