Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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