Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms