Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms