Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFAP36Q96G28 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms