Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms