Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms