Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms