Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113Q902F9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms