Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG1Q8WVM7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms