Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms