Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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