Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARRDC4Q8NCT1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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