Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms