Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG2Q8N3U4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms