Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms