Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP4Q8IVH2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms