Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CERS3Q8IU89 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERS3Q8IU89 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms