Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYT9Q86SS6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms