Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms