Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms