Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNDC1Q76NI1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms