Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMUB2Q71RG4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms