Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
USP31Q70CQ4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP31Q70CQ4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms