Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXIP1Q6ZW49 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms