Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM43BQ6ZT52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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