Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms