Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC2Q6ZN30 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms