Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms