Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC27Q6UX04 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms