Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms