Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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