Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms