Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms