Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms