Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms